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全基因组重测序

全基因组重测序

简要描述:
全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。

更新时间:2019-12-30

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厂商性质:其他

一、服务介绍

全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。基于全基因组重测序技术,我们能够快速的进行种子资源普查筛选,寻找到大量基因变异,并实现遗传进化分析及重要性状候选基因预测。而随着测序成本降低和已知基因组序列的物种增多,重测序已成为动植物育种研究中为迅速有效的方法之一。

 

二、操作流程

提取基因组 DNA 并随机打断,电泳回收所需长度的 DNA 片段,并加上接头进行 Cluster制备,后上机测序。利用双末端( Paired-End) 的方案对插入片段两端进行测序,除获得序列信息外,还有利于大片段结构变异的挖掘。

 

三、指标评价

测序深度是评价测序量的重要指标,测序深度的增加有利于基因组覆盖度的上升,并同时减少测序的错误率。在重测序个体水平采用双末端测序,当测序深度在 10X 以上时,基因组覆盖度和测序错误率控制均得以。而在群体方面,3-5X 即可得到。

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